
تدور أحداث الفيلم في إطار من الكوميديا والمغامرات والحركة حول محاولات سلاحف النينجا لمواجهة خطط عدوهم الأزلي شريدر الشريرة لتدمير مدينة نيويورك والسيطرة على العالم والتي يحاول تنفيذها تلك المرة بواسطة غزو خارجي، بعدما يطور الدكتور باكستر نماذج مشابهة للسلاحف لتنفيذ خطته الإجرامية، بينما تتعاون السلاحف مع أبريل وفيرن للحفاظ على سلامة مدينتهم.